Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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