Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TCIRG1Q13488 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms