Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CEACAM7-201ENST00000006724 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL158206.1-201ENST00000563205 1965 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 FANK1-201ENST00000368689 522 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL353052.1-201ENST00000428673 818 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 KRTAP9-11P-201ENST00000431013 525 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 GGT3P-203ENST00000445651 368 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RN7SL418P-201ENST00000473031 287 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC087393.3-201ENST00000584971 166 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC108724.2-201ENST00000634593 290 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 HGF-209ENST00000457544 2249 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC139256.1-201ENST00000569858 2598 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 UBQLN3-201ENST00000311659 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 C1QTNF7-204ENST00000429690 4464 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC078795.1-201ENST00000602342 3143 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 KRT18P54-201ENST00000513396 748 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC124067.1-201ENST00000517897 169 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPL10P19-201ENST00000519013 301 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC090607.2-201ENST00000560331 695 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 DTNA-220ENST00000590831 847 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 KLF5-205ENST00000539231 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms