Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
DUSP4Q13115 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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