Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms