Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHD3Q12873 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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