Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms