Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
SSFA2P28290 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SSFA2P28290 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms