Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMIGD3P0DMS9 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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