Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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