Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
EHD3Q9NZN3 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms