Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRRIQ1Q96JM4 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms