Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MMP26-201ENST00000300762 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PHACTR1-204ENST00000379348 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC012594.1-235ENST00000424391 727 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 HNRNPCP9-201ENST00000426952 859 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC00112-201ENST00000432830 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SL159P-201ENST00000485164 292 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AP000797.3-201ENST00000537491 548 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC104046.1-201ENST00000559487 406 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 DNM1P34-202ENST00000567850 315 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC016876.3-201ENST00000610459 426 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC018926.2-201ENST00000611214 498 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ARL17B-208ENST00000622877 565 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FHL1-229ENST00000629039 1501 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms