Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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