Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
FSCN1Q16658 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms