Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZNF56Q15929 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZNF56Q15929 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZNF56Q15929 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZNF56Q15929 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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ZNF56Q15929 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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ZNF56Q15929 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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ZNF56Q15929 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZNF56Q15929 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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