Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SIX1Q15475 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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SIX1Q15475 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SIX1Q15475 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SIX1Q15475 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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