Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms