Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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