Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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COL4A6Q14031 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL4A6Q14031 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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