Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms