Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RUNX3Q13761 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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