Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
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