Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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