Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms