Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACADSBP45954 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms