Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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CCDC142Q17RM4 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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