Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 IGHVIII-13-1-201ENST00000517613 291 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 NAV1-202ENST00000367296 13091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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