Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDKN3Q16667 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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