Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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