Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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VAMP3Q15836 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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