Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms