Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HERC1Q15751 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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