Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TAF1AQ15573 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TAF1AQ15573 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TAF1AQ15573 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TAF1AQ15573 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TAF1AQ15573 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TAF1AQ15573 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TAF1AQ15573 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TAF1AQ15573 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TAF1AQ15573 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms