Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SIX1Q15475 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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SIX1Q15475 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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