Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms