Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ALCAMQ13740 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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