Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTCH1Q13635 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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