Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CUL1Q13616 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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CUL1Q13616 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CUL1Q13616 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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CUL1Q13616 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CUL1Q13616 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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