Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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