Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SP140Q13342 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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