Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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TRAF1Q13077 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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