Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TM4SF4P48230 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TM4SF4P48230 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms