Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COPS7AQ9UBW8 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms