Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4Q9P0V3 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms