Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL715P-201ENST00000606972 286 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC069499.2-201ENST00000610665 382 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
SPOCK3Q9BQ16 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 MIR3680-2-201ENST00000578247 87 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 MIR3680-1-201ENST00000581433 87 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 SLC14A1-214ENST00000589700 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SPOCK3Q9BQ16 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms