Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
IMPG1Q17R60 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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