Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
LAMA3Q16787 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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