Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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