Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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